Экспозиция «Крестьянская война 1773-1775 годов под предводительством Е.И.Пугачева» открывает одну из самых трагических и противоречивых страниц истории России. Посетители Музея истории Оренбурга могут узнать о причинах Крестьянской войны 1773-1775 годов, о событиях, предшествовавших её началу, проследить развитие событий Крестьянской войны на территории Оренбургской губернии.
В экспозиции представлены ядра и сигнальная пушка времен Крестьянской войны 1773-1775 г.г., карта «Крестьянская война 1773-1775г.г. под предводительством Е.Пугачева», диорама «Штурм повстанческой армией Е.И.Пугачева города-крепости Оренбург», клетка, в которой Е.Пугачев содержался в тюрьме на Монетном дворе в Москве около двух месяцев накануне казни (точная копия с оригинала). Эти и другие интересные экспонаты эмоционально приближают наших современников к событиям Крестьянской войны, позволяют понять их трагический смысл.
По данным историка XIX века В.Н. Витевского, в Российской империи в 1773-1775 годах. погибло около 100 тысяч человек, представителей различных сословий и национальностей. Спустя 60 лет после окончания Крестьянской войны её события в своей исторической прозе отразил великий русский поэт и писатель А.С.Пушкин. Эта тема интересует и наших современников. В 1998-1999 годы в Оренбургской области происходили съемки фильма «Русский бунт», созданного по мотивам документальной повести А.С.Пушкина «История Пугачевского бунта» и художественной повести «Капитанская дочка». После окончания съемок Музею истории Оренбурга были переданы реквизиты - пушечные лафеты и повстанческие знамена, которые представлены в экспозиции.